Vorrunde
Sechs Gruppen zu je vier Mannschaften wurden zwischen dem 20. und 24. Januar 2011 in Mini-Turnieren ausgetragen. Die Gruppensieger erreichten die Qualifikationsrunde.

Qualifikationsrunde
Die sechs Gruppensieger aus der Vorrunde trafen nun in sechs Gruppen zu je vier Teams auf die 18 topgesetzten Qualifikanten. Zwischen dem 24. und 28. Februar 2011 wurden die Mini-Turniere jeweils an einem bestimmten Austragungsort ausgespielt. Die Gruppensieger und fünf besten Zweitplatzierten erreichten die Endrunde, wo sie auf den automatisch qualifizierten Gastgeber Kroatien treffen.

Endrunde
Die Endrunde vom 31. Januar bis 11. Februar 2012 wird mit vier Gruppen zu je drei Teams ausgetragen. Die Erst- und Zweitplatzierten erreichen das Viertelfinale und die K.-o.-Runden.

Reglement
Das Reglement für die UEFA-Futsal-Europameisterschaft wurde zunächst von der UEFA-Administration entworfen und dann an das UEFA-Komitee für Futsal und Beach Soccer weitergeleitet. Nach der Zustimmung des Komitees wurde das Reglement vom UEFA-Exekutivkomitee abgesegnet.